GenomeStudio分析软件流程
更新时间:2024-04-16 06:07:01 阅读量: 综合文库 文档下载
GenomeStudio分析软件使用简单流程
一、导入数据简单分析
双击GenomeStudio软件图标,打开软件,进入如下界面,在软件界面的右侧中有相应的说明书和模块进行下载安装。
根据需要分析的要求选择相应的模块分析,下面已Genotyping为例介绍。 单击
的进入如下界面:
,进入数据导入窗口,导入数据的流程与KaryoStudio相类似,在最后
选择相应的栏目,如下图所示:
点击“Finish”,完成数据导入流程,软件自动运算,运算完成之后出现如下界面:
选择:tool菜单下的Show Genome Viewer…等待运算后,软件自动跳出相应的选择界面:
选择需要分析的标本和需要看到相关的参数,点击ADD 将所选择的栏目添加到右侧的空白栏中,界面如下:
点击OK,进入如下界面:
选择updata,软件自动运算显示染色体相应信息 可以逐个样本进行分析:
选择相应的样本后,点击updata,右侧的对话框中会显示全部染色体的相关信息,右侧的对话框的
可以显示全部染色体的信息,点击也可以对显示信息进行编辑。
分析数据时可以逐个染色体分析,发现有异常区域时,可以双击异常区域在染色体上相应的位置,进行进一步的放大观察分析,具体步骤如下面图解:
可以选择需要显示染色体的信息,
图中放大的区域部分为缺失,在B allele Freq.图中缺少了中间杂合的信息。 下图显示的是重复的情况:
二、输出报告
点击下面界面上的analysis菜单下的reports 下面的 report wizard
选择final report 点击NEXT,进入一级菜单,根据实验需要选择,在如下对话框中,可以根据需要输出的数据选择hide 或者show
编辑完成之后,点击next ,最后选择输出的路径和文件名,完成报告输出。
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