总结-酵母酶活测定
更新时间:2024-04-17 20:24:01 阅读量: 综合文库 文档下载
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2.9.3 β-Galactosidase 酶活定量实验
参考Clontech Yeast Protocols Handbook进行。 酵母酶活测定,
准备:每个样品,8 ml 的YPD培养基,Y190 菌株(转化用)。 Z buffer, Z buffer+beta-巯基乙醇, Z buffer+ONPG, NA2CO3
1) 准备5 ml SD/-Leu /-Trp液体培养基过夜培养的酵母菌,同时将ONPG溶解在Z缓冲液中(4 mg/ml,调pH 7.0)并振荡混匀1-2 hr;
2) 旋涡振荡器上将菌液剧烈振荡0.5-1 min,立刻取出2 ml加入8 ml的YPDA中;
3) 30℃ 250 rpm摇3-5 hr,测OD600在0.5-0.8之间并记录确切OD值; 4) 取3个1.5 ml的EP 分别倒入1.5 ml菌液,14,000 rpm离心30 sec,小心弃上清,加入1.5 ml Z缓冲液,振荡以重悬菌体;
5) 离心去上清,加入300 μl Z缓冲液重悬菌体(则浓缩倍数为1.5/0.3=5倍); 6) 取0.1 ml至新管中,液氮冷冻0.5-1 min,37℃ 0.5-1 min使其融化; 7) 反复冻融3次以上使细胞尽可能破碎;
8) 取一个新管加入100 μl Z缓冲液作为空白对照;
9) 每管中加入0.7 ml Z缓冲液+β-巯基乙醇,加入160 μl 溶在Z缓冲液中的ONPG同时开始计时,将管置于30℃温浴;
10) 当溶液变为黄色时,加入0.4 ml Na2CO3中止反应,计录反应时间t; 11) 14,000 rpm离心10 min,取上清,测OD420值; 12) 计算β-Galactosidase 酶活:
β-Galactosidase units=1,000×OD420(t×V×OD600) t为反应时间(第10步记录) V为0.1×浓缩倍数(第5步记录) OD600为第3步所测OD值
2.9.4 提取酵母蛋白
参考Clontech Yeast Protocols Handbook进行。 1) 接酵母菌于SD/-Leu /-Trp培养基中,30℃摇培过夜; 2) 扩培至50 ml YPDA培养基中,30℃摇培至OD600为0.4-0.6,计算总OD600值:测得的OD600值×培养液体积;
3) 将菌倒入预冷的离心管中,4℃ 1000×g 5 min,弃上清,细胞重悬于50 ml预冷的超纯水中;
4) 4℃ 1000×g 5 min,弃上清,冷的超纯水再洗一次,沉淀冻到液氮中,继续下面的实验或冻存于-80℃;
5) 每7.5 OD600加入100 μl 60℃预热的裂解缓冲液(用前加入PMSF和cocktail,因PMSF 有半衰期,需每隔7 min补一次),60℃水浴小于2 min使菌体融化并重悬起来;
6) 转移到1.5 ml的EP管中,加入适量glass beads(80 μl/7.5 OD600),70℃ 10 min,剧烈振荡1 min;
7) 4℃ 14,000 rpm离心5 min,将上清转移至新的EP管中并置于冰上;
8) 沉淀置于100℃ 3-5 min,剧烈振荡1 min,4℃ 14,000 rpm离心5 min,小心吸取上清,并将两次的上清合到一起;
9) 100℃ 10 min煮样,即可进行western blot。 试剂配置
YPDA培养基:1 L配方:20 g Difo peptone,10 g Yeast extract,15 ml 0.2% adenine hemisulfate solution,加水至950 ml,灭菌后冷
却至55℃再加入50 ml 40%的葡萄糖(葡萄糖溶液可112℃灭菌或抽滤灭菌),若为固体培养基灭菌前还需加20 g/L Agar;
SD/-Leu /-Trp培养基:6.7 g/L Yeast nitrogen without amino acids,0.67 g/L -Leu /-Trp DO supplement,若为固体培养基需加20 g/L Agar,灭菌;
SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp培养基:6.7 g/L Yeast nitrogen without amino acids,0.6 g/L -Ade/-His /-Leu /-Trp DO supplement,若为固体培养基需加20 g/L Agar,灭菌;
贮存液:10×TE:0.1 M Tris-HCl,10 mM EDTA,调pH 7.5灭菌,
10×LiAc:1 M LiAc,乙酸调pH 7.5灭菌, 50% PEG4000;
PEG/LiAc:40% PEG,1×TE,1×LiAc;
Z缓冲液:16.1 g/L Na2HPO4·7H2O,5.5 g/L NaH2PO4·H2O,0.75 g/L KCl,0.246 g/L MgSO4·7H2O,调pH 7.0并灭菌;
Z缓冲液+β-巯基乙醇:100 ml Z缓冲液加入0.27 mlβ-巯基乙醇;
裂解缓冲液:储存液:8 M尿素,5% SDS,40 mM Tris-HCl(pH6.8),0.1 mM EDTA,0.4 mg/ml溴酚兰,使用前每毫升储存液加入10 μl β-巯基乙醇,并加蛋白酶抑制剂PMSF和cocktail。
2.10 酵母互补实验
所用的载体为Dr. Hiten D. Madhani实验室(University of California)惠赠的p415-ADH1改造,用ADH1启动子驱动或将ADH1启动子换为酵母BRE1启动子,分别连接拟南芥的HUB1和HUB2基因,构建好的质粒转化酵母bre1Δ(YM1740),空载体转化野生型YM1736(S288C)及bre1Δ(YM1740)作为对照,统计细胞体积大小参照Hwang et al.(2003)进行,大体流程如下:
1) 将酵母菌接于SD/-Leu培养基中,30℃摇培至OD600 0.6-0.8; 2) 加入2%甲醛,30℃ 20 min固定;
3) 离心收集菌体,用0.1 M的磷酸钾(pH6.5)洗2次; 4) 细胞重悬于1 ml P溶液中(0.1 M的磷酸钾[pH6.5],1.2 M山梨醇),4℃待用;
取10 μl加入1 ml 0.1 M的磷酸钾(pH6.5),用流式细胞仪统计细胞体积的大小,每个株系统计约3-5×104个细胞。
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